Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Uspl1Q3ULM6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uspl1Q3ULM6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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