Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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