Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga1P29974 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms