Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbip1J3QMK2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms