Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms