Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms