Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Gpc1Q9QZF2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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Gpc1Q9QZF2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Gpc1Q9QZF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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Gpc1Q9QZF2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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