Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms