Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms