Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mdc1Q5PSV9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdc1Q5PSV9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms