Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms