Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms