Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sdr16c6Q05A13 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms