Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoP15409 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoP15409 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoP15409 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoP15409 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms