Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms