Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms