Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc8Q9CYA6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc8Q9CYA6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms