Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc30Q8BVF4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms