Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nkx6-3Q3UHX8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-3Q3UHX8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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