Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms