Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga1P29974 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms