Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb3P09026 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms