Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms