Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms