Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AatfQ9JKX4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AatfQ9JKX4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms