Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms