Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uspl1Q3ULM6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uspl1Q3ULM6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms