Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms