Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MitfQ08874 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.2 ms