Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms