Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prf1P10820 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prf1P10820 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms