Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUB1	Q6Q546	Q0017	Q0017	162 nt		-6.5	□□□□□ -3.45
HUB1	Q6Q546	snR64	snR64	101 nt		-6.66	□□□□□ -3.48
HUB1	Q6Q546	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-6.67	□□□□□ -3.48
HUB1	Q6Q546	YOR225W	YOR225W	330 nt		-6.74	□□□□□ -3.49
HUB1	Q6Q546	YLR294C	YLR294C	330 nt		-6.78	□□□□□ -3.49
HUB1	Q6Q546	snR62	snR62	100 nt		-6.83	□□□□□ -3.5
HUB1	Q6Q546	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-6.88	□□□□□ -3.51
HUB1	Q6Q546	VAR1	Q0140	1197 nt		-6.88	□□□□□ -3.51
HUB1	Q6Q546	snR40	snR40	97 nt		-6.94	□□□□□ -3.52
HUB1	Q6Q546	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-7.14	□□□□□ -3.55
HUB1	Q6Q546	snR61	snR61	90 nt		-7.26	□□□□□ -3.57
HUB1	Q6Q546	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-7.26	□□□□□ -3.57
HUB1	Q6Q546	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-7.46	□□□□□ -3.6
HUB1	Q6Q546	YLR149C-A	YLR149C-A	87 nt		-7.5	□□□□□ -3.61
HUB1	Q6Q546	YNL338W	YNL338W	159 nt		-7.51	□□□□□ -3.61
HUB1	Q6Q546	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-7.71	□□□□□ -3.64
HUB1	Q6Q546	snR53	snR53	91 nt		-7.74	□□□□□ -3.65
HUB1	Q6Q546	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-7.87	□□□□□ -3.67
HUB1	Q6Q546	Q0032	Q0032	291 nt		-7.98	□□□□□ -3.69
HUB1	Q6Q546	Q0143	Q0143	153 nt		-8.22	□□□□□ -3.73
HUB1	Q6Q546	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-8.34	□□□□□ -3.74
HUB1	Q6Q546	YMR326C	YMR326C	309 nt		-8.4	□□□□□ -3.75
HUB1	Q6Q546	YHR217C	YHR217C	462 nt		-8.89	□□□□□ -3.83
HUB1	Q6Q546	Q0144	Q0144	330 nt		-9.09	□□□□□ -3.86
HUB1	Q6Q546	snR75	snR75	89 nt		-9.86	□□□□□ -3.99
HUB1	Q6Q546	ATP8	Q0080	147 nt		-9.89	□□□□□ -3.99
HUB1	Q6Q546	YBL109W	YBL109W	336 nt		-9.93	□□□□□ -4
HUB1	Q6Q546	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-10.18	□□□□□ -4.04
HUB1	Q6Q546	Q0092	Q0092	141 nt		-11.23	□□□□□ -4.21

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