Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2surpQ6NV83 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms