Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms