Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a5Q5RJI2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a5Q5RJI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms