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Protein–RNA interactions for Protein: Q12466
TCB1, Tricalbin-1, yeast
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1,186 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
TCB1
Q12466
snR128
snR128
126 nt
0.53
□□□□□ -2.32
TCB1
Q12466
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
0.39
□□□□□ -2.35
TCB1
Q12466
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.38
□□□□□ -2.35
TCB1
Q12466
snR161
snR161
161 nt
0.35
□□□□□ -2.35
TCB1
Q12466
RPL41B
YDL133C-A
78 nt
0.32
□□□□□ -2.36
TCB1
Q12466
YOR335W-A
YOR335W-A
81 nt
0.32
□□□□□ -2.36
TCB1
Q12466
tC(GCA)Q
tC(GCA)Q
76 nt
0.29
□□□□□ -2.36
TCB1
Q12466
snR6
snR6
112 nt
0.28
□□□□□ -2.36
TCB1
Q12466
snR73
snR73
106 nt
0.1
□□□□□ -2.39
TCB1
Q12466
snR58
snR58
96 nt
0.09
□□□□□ -2.4
TCB1
Q12466
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
TCB1
Q12466
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
TCB1
Q12466
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
TCB1
Q12466
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.26
□□□□□ -2.45
TCB1
Q12466
YOR309C
YOR309C
381 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
TCB1
Q12466
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
TCB1
Q12466
snR33
snR33
183 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
TCB1
Q12466
snR87
snR87
109 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
TCB1
Q12466
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
TCB1
Q12466
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
TCB1
Q12466
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
TCB1
Q12466
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-0.94
□□□□□ -2.56
TCB1
Q12466
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-0.96
□□□□□ -2.56
TCB1
Q12466
YNR077C
YNR077C
255 nt
-0.96
□□□□□ -2.56
TCB1
Q12466
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-1.85
□□□□□ -2.71
TCB1
Q12466
YDR543C
YDR543C
300 nt
-2.18
□□□□□ -2.76
TCB1
Q12466
YJL136W-A
YJL136W-A
84 nt
-2.29
□□□□□ -2.78
TCB1
Q12466
YOL166W-A
YOL166W-A
156 nt
-2.38
□□□□□ -2.79
TCB1
Q12466
YJR162C
YJR162C
351 nt
-3.11
□□□□□ -2.91
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