Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-3.84□□□□□ -3.02
PEX11Q12462 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-3.92□□□□□ -3.04
PEX11Q12462 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.92□□□□□ -3.04
PEX11Q12462 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-3.99□□□□□ -3.05
PEX11Q12462 YNL338WYNL338W 159 nt-4□□□□□ -3.05
PEX11Q12462 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-4.03□□□□□ -3.05
PEX11Q12462 snR58snR58 96 nt-4.13□□□□□ -3.07
PEX11Q12462 snR62snR62 100 nt-4.15□□□□□ -3.07
PEX11Q12462 snR64snR64 101 nt-4.17□□□□□ -3.08
PEX11Q12462 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-4.21□□□□□ -3.08
PEX11Q12462 snR61snR61 90 nt-4.24□□□□□ -3.09
PEX11Q12462 YNL170WYNL170W 396 nt-4.29□□□□□ -3.1
PEX11Q12462 YLR294CYLR294C 330 nt-4.37□□□□□ -3.11
PEX11Q12462 YOR225WYOR225W 330 nt-4.47□□□□□ -3.13
PEX11Q12462 Q0032Q0032 291 nt-4.53□□□□□ -3.13
PEX11Q12462 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.71□□□□□ -3.16
PEX11Q12462 snR40snR40 97 nt-4.79□□□□□ -3.18
PEX11Q12462 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-4.87□□□□□ -3.19
PEX11Q12462 snR53snR53 91 nt-4.92□□□□□ -3.2
PEX11Q12462 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.98□□□□□ -3.21
PEX11Q12462 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-5.1□□□□□ -3.23
PEX11Q12462 YHR217CYHR217C 462 nt-5.33□□□□□ -3.26
PEX11Q12462 YMR326CYMR326C 309 nt-5.34□□□□□ -3.26
PEX11Q12462 ATP8Q0080 147 nt-5.56□□□□□ -3.3
PEX11Q12462 Q0143Q0143 153 nt-5.58□□□□□ -3.3
PEX11Q12462 YBL109WYBL109W 336 nt-5.94□□□□□ -3.36
PEX11Q12462 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-6.21□□□□□ -3.4
PEX11Q12462 Q0092Q0092 141 nt-6.38□□□□□ -3.43
PEX11Q12462 snR75snR75 89 nt-6.6□□□□□ -3.47
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.8 ms