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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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Length
404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
YKL096C-B
YKL096C-B
150 nt
-2.81
□□□□□ -2.86
REX3
Q12090
YDL159W-A
YDL159W-A
132 nt
-2.86
□□□□□ -2.87
REX3
Q12090
YGR122C-A
YGR122C-A
129 nt
-2.88
□□□□□ -2.87
REX3
Q12090
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-2.93
□□□□□ -2.88
REX3
Q12090
snR58
snR58
96 nt
-2.95
□□□□□ -2.88
REX3
Q12090
YGL007C-A
YGL007C-A
87 nt
-3.07
□□□□□ -2.9
REX3
Q12090
Q0032
Q0032
291 nt
-3.09
□□□□□ -2.9
REX3
Q12090
snR64
snR64
101 nt
-3.18
□□□□□ -2.92
REX3
Q12090
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
-3.18
□□□□□ -2.92
REX3
Q12090
snR62
snR62
100 nt
-3.22
□□□□□ -2.92
REX3
Q12090
YJL136W-A
YJL136W-A
84 nt
-3.26
□□□□□ -2.93
REX3
Q12090
YLR294C
YLR294C
330 nt
-3.26
□□□□□ -2.93
REX3
Q12090
snR61
snR61
90 nt
-3.33
□□□□□ -2.94
REX3
Q12090
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
-3.33
□□□□□ -2.94
REX3
Q12090
YNL170W
YNL170W
396 nt
-3.33
□□□□□ -2.94
REX3
Q12090
YOR225W
YOR225W
330 nt
-3.33
□□□□□ -2.94
REX3
Q12090
tC(GCA)Q
tC(GCA)Q
76 nt
-3.35
□□□□□ -2.95
REX3
Q12090
snR40
snR40
97 nt
-3.47
□□□□□ -2.96
REX3
Q12090
YLR149C-A
YLR149C-A
87 nt
-3.62
□□□□□ -2.99
REX3
Q12090
snR53
snR53
91 nt
-3.73
□□□□□ -3.01
REX3
Q12090
YLL066W-B
YLL066W-B
171 nt
-3.93
□□□□□ -3.04
REX3
Q12090
YHR217C
YHR217C
462 nt
-4.17
□□□□□ -3.08
REX3
Q12090
ATP8
Q0080
147 nt
-4.19
□□□□□ -3.08
REX3
Q12090
YMR326C
YMR326C
309 nt
-4.19
□□□□□ -3.08
REX3
Q12090
Q0143
Q0143
153 nt
-4.42
□□□□□ -3.12
REX3
Q12090
YBL109W
YBL109W
336 nt
-4.6
□□□□□ -3.15
REX3
Q12090
YDL247W-A
YDL247W-A
75 nt
-4.84
□□□□□ -3.18
REX3
Q12090
Q0092
Q0092
141 nt
-4.85
□□□□□ -3.19
REX3
Q12090
snR75
snR75
89 nt
-4.87
□□□□□ -3.19
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