Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 snR64snR64 101 nt-8.07□□□□□ -3.7
ATG2P53855 YLR294CYLR294C 330 nt-8.09□□□□□ -3.7
ATG2P53855 snR40snR40 97 nt-8.1□□□□□ -3.71
ATG2P53855 Q0017Q0017 162 nt-8.17□□□□□ -3.72
ATG2P53855 snR62snR62 100 nt-8.34□□□□□ -3.74
ATG2P53855 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-8.35□□□□□ -3.75
ATG2P53855 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-8.65□□□□□ -3.79
ATG2P53855 Q0143Q0143 153 nt-8.74□□□□□ -3.81
ATG2P53855 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-8.9□□□□□ -3.83
ATG2P53855 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-8.91□□□□□ -3.84
ATG2P53855 snR61snR61 90 nt-8.98□□□□□ -3.85
ATG2P53855 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-9.03□□□□□ -3.85
ATG2P53855 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-9.09□□□□□ -3.86
ATG2P53855 snR53snR53 91 nt-9.25□□□□□ -3.89
ATG2P53855 VAR1Q0140 1197 nt-9.48□□□□□ -3.93
ATG2P53855 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-9.53□□□□□ -3.93
ATG2P53855 YNL338WYNL338W 159 nt-9.63□□□□□ -3.95
ATG2P53855 Q0032Q0032 291 nt-9.85□□□□□ -3.99
ATG2P53855 YMR326CYMR326C 309 nt-9.88□□□□□ -3.99
ATG2P53855 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-10.02□□□□□ -4.01
ATG2P53855 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-10.2□□□□□ -4.04
ATG2P53855 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-10.43□□□□□ -4.08
ATG2P53855 YHR217CYHR217C 462 nt-10.91□□□□□ -4.16
ATG2P53855 snR75snR75 89 nt-11.62□□□□□ -4.27
ATG2P53855 ATP8Q0080 147 nt-12.37□□□□□ -4.39
ATG2P53855 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-12.39□□□□□ -4.39
ATG2P53855 YBL109WYBL109W 336 nt-12.41□□□□□ -4.4
ATG2P53855 Q0144Q0144 330 nt-12.5□□□□□ -4.41
ATG2P53855 Q0092Q0092 141 nt-14.03□□□□□ -4.66
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 120.1 ms