Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5cP41230 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5cP41230 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms