Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.64□□□□□ -2.83
DDI1P40087 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.65□□□□□ -2.83
DDI1P40087 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.68□□□□□ -2.84
DDI1P40087 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.7□□□□□ -2.84
DDI1P40087 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.7□□□□□ -2.84
DDI1P40087 snR58snR58 96 nt-2.75□□□□□ -2.85
DDI1P40087 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.75□□□□□ -2.85
DDI1P40087 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.75□□□□□ -2.85
DDI1P40087 YJR162CYJR162C 351 nt-2.76□□□□□ -2.85
DDI1P40087 snR61snR61 90 nt-2.77□□□□□ -2.85
DDI1P40087 snR62snR62 100 nt-2.9□□□□□ -2.87
DDI1P40087 snR64snR64 101 nt-2.94□□□□□ -2.88
DDI1P40087 YNL170WYNL170W 396 nt-3□□□□□ -2.89
DDI1P40087 YLR294CYLR294C 330 nt-3.07□□□□□ -2.9
DDI1P40087 YOR225WYOR225W 330 nt-3.07□□□□□ -2.9
DDI1P40087 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.11□□□□□ -2.91
DDI1P40087 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.14□□□□□ -2.91
DDI1P40087 snR40snR40 97 nt-3.25□□□□□ -2.93
DDI1P40087 ATP8Q0080 147 nt-3.43□□□□□ -2.96
DDI1P40087 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.43□□□□□ -2.96
DDI1P40087 snR53snR53 91 nt-3.48□□□□□ -2.97
DDI1P40087 YMR326CYMR326C 309 nt-3.6□□□□□ -2.99
DDI1P40087 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-3.62□□□□□ -2.99
DDI1P40087 Q0143Q0143 153 nt-3.65□□□□□ -2.99
DDI1P40087 YHR217CYHR217C 462 nt-3.65□□□□□ -2.99
DDI1P40087 Q0092Q0092 141 nt-3.98□□□□□ -3.05
DDI1P40087 YBL109WYBL109W 336 nt-4.1□□□□□ -3.07
DDI1P40087 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-4.39□□□□□ -3.11
DDI1P40087 snR75snR75 89 nt-4.51□□□□□ -3.13
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.5 ms