Protein–RNA interactions for Protein: P38750

YHL008C, Uncharacterized transporter YHL008C, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CP38750 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL008CP38750 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.25□□□□□ -2.37
YHL008CP38750 snR161snR161 161 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL008CP38750 YJL113WYJL113W 4647 nt0.19□□□□□ -2.38
YHL008CP38750 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.09□□□□□ -2.4
YHL008CP38750 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.09□□□□□ -2.4
YHL008CP38750 snR6snR6 112 nt0.05□□□□□ -2.4
YHL008CP38750 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHL008CP38750 snR73snR73 106 nt-0.1□□□□□ -2.43
YHL008CP38750 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.14□□□□□ -2.43
YHL008CP38750 snR58snR58 96 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHL008CP38750 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHL008CP38750 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHL008CP38750 URB1YKL014C 5295 nt-0.26□□□□□ -2.45
YHL008CP38750 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHL008CP38750 YOR309CYOR309C 381 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHL008CP38750 snR33snR33 183 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHL008CP38750 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHL008CP38750 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHL008CP38750 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHL008CP38750 snR87snR87 109 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHL008CP38750 YNR077CYNR077C 255 nt-0.78□□□□□ -2.53
YHL008CP38750 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.88□□□□□ -2.55
YHL008CP38750 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.9□□□□□ -2.55
YHL008CP38750 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.63□□□□□ -2.67
YHL008CP38750 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.94□□□□□ -2.72
YHL008CP38750 YDR543CYDR543C 300 nt-2.02□□□□□ -2.73
YHL008CP38750 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.16□□□□□ -2.76
YHL008CP38750 YJR162CYJR162C 351 nt-2.82□□□□□ -2.86
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 47 ms