Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms