Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc1Q9QZF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms