Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms