Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sh3glb1Q9JK48 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms