Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm4Q8K215 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lyrm4Q8K215 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms