Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8BPC6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8BPC6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms