Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf4Q8BH24 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms