Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2surpQ6NV83 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms